產(chǎn)品簡介
擴增子測序,即對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序,主要包括16S rDNA測序、18S rDNA測序及ITS測序等。擴增子測序通常是選擇某個或某幾個變異區(qū)域,利用保守區(qū)設計通用引物進行PCR擴增,然后對高變區(qū)進行測序分析和菌種鑒定,具有所需樣本量少、高通量和高精確性等特點。組學實驗
數(shù)據(jù)分析策略
1.從測序所得的原始數(shù)據(jù)出發(fā),首先對原始數(shù)據(jù)進行質控,得到有效數(shù)據(jù)(Clean Data);
2.基于有效數(shù)據(jù)進行OTUs(Operational Taxonomic Units)聚類;
3.根據(jù)OTUs聚類結果,一方面對每個OTU的代表序列做物種注釋,得到對應的物種信息,另一方面將各個樣品的有效數(shù)據(jù),和代表序列進行比對,獲得對應OTU在各個樣品中的豐度分布情況;雙熒光素酶實驗
4.基于構建好的OTU豐度表,獲得不同分類層級的物種豐度表;
5.基于OTU豐度表及不同分類層級的豐度表,進行樣品微生物群落組成分析;
6.基于OTU豐度表及不同分類層級的豐度表,進行Alpha多樣性和Beta多樣性分析;
7.根據(jù)研究需求,可選擇高級分析,深入挖掘樣品中的物種組成和差異。細胞動物整體實驗
數(shù)據(jù)分析內容